Заведение в 1С поступления товаров и услуг

Добрый день!
Ситуация следующая, транспортные компании оказывают услугу перевозки, оплата проводится на основании вернувшихся документов с отметкой грузополучателя (тн и ттн), а так же доков от перевозчика(акт выполненных работ, счёт, счет-фактура). Но, к сожалению, не всегда документы приходят быстро, перевозы в разных городах,а так же не всегда их сразу заводят в 1с. Соответственно, при формировании акта сверки получается не корректная картина. 
Возможно ли выставление нам счёта до прихода документов, допустим по электронике и заведение его в 1с, но отображать его только в управленческом учете, а по факту прихода документов, уже проводить в бухгалтерском и налоговом учете. На сколько это правомерно и не вызовет ли вопросов и сложностей со стороны налоговой или аудиторов?
Заранее спасибо за ответ!